植物星球计划正式启动，将绘制完整的“植物生命之树”

在这个星球上，生长着各类形态各异、不同种类的植物。然而，我们对其却所知甚少。2000年，首个植物基因组——拟南芥基因组发布，26年过去，仍有超过99%的陆地植物缺乏高质量的参考基因组，这严重限制了人类对植物多样性、适应性及功能潜力的深入认知与应用开发。

为了打破这一现状，中国农业科学院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）联合中国植物学会、北京大学等国内外49家单位共同发起“植物星球计划（PLANeT）”，并于2月11日在北京正式启动，旨在通过解码陆地植物主要谱系的遗传密码，绘制完整的“植物生命之树”，以应对粮食安全、生物多样性保护、新药发现和可持续发展等全球性挑战。

绘制完整的“植物生命之树”

在亿万年的进化历程中，植物演化出了多样的形态，追溯植物进化史上的关键“节点”，有助于揭示植物进化中共有和特有性状的遗传基础。然而，由于基因组数据的零散与缺口，许多关键进化关系悬而未决。

“植物星球计划”主要负责人、中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员王丽介绍道，“植物星球计划”希望通过对缺乏参考基因组的目、科进行采样，借助系统发育基因组学方法，构建一个高分辨率、时间校准的完整陆地植物系统发育树，从根本上厘清所有主要植物类群之间的亲缘关系与分化时间，从而绘制完整的植物“生命之树”。

五大布局，解锁植物研究新图景

“植物星球计划”是由中国科学家发起并主导的国际大科学计划，已汇聚15国40余个机构的科研力量。具体来讲，将围绕基础生物学，作物育种，生物多样性保护，天然产物药物发现和AI工具开发等五方面布局。

一是构建覆盖主要植物分支的基因组图谱，揭示植物多样性形成与演化的遗传规律；

二是用系统基因组的”望远镜”纵览进化长河中的进化约束位点，用群体基因组的”显微镜”检测适应性变异和功能位点，二者结合，实现作物育种关键位点的”双重锁定”与精准靶向；

三是利用基因组数据高效评估物种遗传多样性及灭绝风险，为制定科学的保护与修复策略提供核心数据支撑；

四是系统性挖掘植物合成天然产物的遗传密码，加速创新药物发现，服务人类健康；

五是利用人工智能破译植物基因组的分子序列法则，推动生命科学研究范式的根本性转变。

让AI读懂植物的“共同语言”

值得注意的是，有了关键的基因组数据，如何处理、利用数万个基因组产生的海量数据成了“植物星球计划”面临的另一大难题。“面对如此繁杂的数据，人工很难处理。”王丽说。为了进一步加速项目进度，减轻人工负担，“植物星球计划”引入了人工智能算法和模型，让AI学习并破译植物的“共同语言”。

王丽介绍，与自然语言处理模型通过学习海量文本掌握语法和语义类似，基因组语言基础模型将通过分析数以万计的不同植物基因组，学习识别DNA序列中保守的“语法”规则、调控元件的组织逻辑以及功能模块的编码模式。“破译了植物的‘共同语言’，我们才能知晓植物在4.7亿年进化历程中的生命基本法则。”王丽说。

庞大的植物基因组数据库的作用还远不止此。随着气候和生态环境的变化，不少植物正在加速消失。传统的保护措施常受限于表型数据的匮乏和采集难度，“植物星球计划”通过分析基因组中的遗传多样性等指标，可以比传统野外监测更高效率地识别出那些遗传基础脆弱、濒临灭绝的物种，从而精准评估植物的濒危状况，为生物多样性评估、稳健保护决策的制定等提供理论依据。此外，通过挖掘植物中抗病、抗旱、耐盐的基因，有助于培育出具有气候韧性的“未来作物”，保障粮食安全。